Trong tháng 6/2019, bến xe Miền Đông chính thức thực hiện chương trình bến xe điện tử trên các phương tiện hoạt động tại bến xe. Theo đó, tất cả phương tiện hoạt động tại đây được dán thẻ chip điện tử để xe ra, vào bến không phải dừng tại các cổng.